Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKAB2O43741 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms