Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMP2AO43633 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMP2AO43633 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms