Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DYNC1LI2O43237 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DYNC1LI2O43237 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms