Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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BC117090L7N257 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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BC117090L7N257 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BC117090L7N257 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BC117090L7N257 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BC117090L7N257 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BC117090L7N257 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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BC117090L7N257 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC117090L7N257 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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BC117090L7N257 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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BC117090L7N257 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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BC117090L7N257 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC117090L7N257 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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