Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
4933406M09RikG3XA12 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933406M09RikG3XA12 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms