Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HHLA1C9JL84 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HHLA1C9JL84 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms