Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTLL13PA6NNM8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms