Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCNX2A6NKB5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCNX2A6NKB5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms