Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNDIG1LA6NDD5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms