Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IRGMA1A4Y4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IRGMA1A4Y4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms