Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00312Q9Y6C7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms