Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKP3Q9Y446 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP3Q9Y446 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms