Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9Y3F1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms