Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF5Q9Y2D1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms