Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp46a1Q9WVK8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp46a1Q9WVK8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms