Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP21Q9UK80 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms