Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX41Q9UJV9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX41Q9UJV9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms