Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX20Q9UHI6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX20Q9UHI6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms