Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCF2Q9UG63 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF2Q9UG63 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms