Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG4Q9UBN1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms