Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL20A1Q9P218 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL20A1Q9P218 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL20A1Q9P218 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL20A1Q9P218 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL20A1Q9P218 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms