Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINM1Q9NU53 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms