Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms