Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SERINC1Q9NRX5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC1Q9NRX5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC1Q9NRX5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SERINC1Q9NRX5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms