Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alyref2Q9JJW6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Alyref2Q9JJW6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms