Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TDRD3Q9H7E2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms