Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf42Q9H799 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf42Q9H799 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms