Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r44Q9EQ47 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms