Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX4Q9BYU1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PBX4Q9BYU1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX4Q9BYU1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX4Q9BYU1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX4Q9BYU1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX4Q9BYU1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX4Q9BYU1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms