Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCMBPQ9BTE3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MCMBPQ9BTE3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms