Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF1Q9BQI6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF1Q9BQI6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms