Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L3Q99457 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L3Q99457 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms