Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CSF3RQ99062 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF3RQ99062 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms