Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf85Q96MD7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms