Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDC3Q96F86 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDC3Q96F86 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms