Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC97Q96F63 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms