Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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