Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3DQ96BQ1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3DQ96BQ1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms