Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIFAP3Q92845 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms