Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GTF3AQ92664 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3AQ92664 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms