Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC1BQ8WUY9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1BQ8WUY9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms