Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNPRQ8TBG9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYNPRQ8TBG9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms