Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCPH1Q8NEM0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms