Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y0

Rnf219, RING finger protein 219, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf219Q8K2Y0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf219Q8K2Y0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf219Q8K2Y0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms