Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC6Q8IVU3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC6Q8IVU3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 758.2 ms