Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFNL1Q8IU54 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNL1Q8IU54 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms