Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPFIBP1Q86W92 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPFIBP1Q86W92 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms