Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dsg1bQ7TSF1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dsg1bQ7TSF1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms