Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFXL1Q6ZNB6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NFXL1Q6ZNB6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms