Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC41PQ6P2S7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC41PQ6P2S7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms