Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE4DIPQ5VU43 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4DIPQ5VU43 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms